Можно ли поменять авиабилеты, если шенгенская виза уже получена

Купила билеты на самолет по маршруту Москва — Амстердам и назад с пересадкой туда в Таллине, обратно — в Риге, что не очень удобно. Уже получила нидерландскую мультивизу, для оформления которой предоставляла эти билеты.

Сейчас нашла прямые перелеты по приемлемым ценам. Если я сдам уже купленные билеты и куплю новые, не скажется ли это при прохождении паспортного контроля? Фиксируются ли где-то (при выдаче визы) мой первоначально заявленный маршрут перелета и авиакомпании, у которых приобретены билеты?